親友アツシ、カスミ、タケシ、ピカチュウが、バイオ技術で作られたスーパーポケモンのミュウツーと対決する。監督は「ポケットモンスター」のテレビシリーズを手がけた湯山邦彦。
この映画の公開に合わせて、バーガーキングは限定のおもちゃが付くキッズミールを発売した。
